Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ep400Q8CHI8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ep400Q8CHI8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms