Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tshz3Q8CGV9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tshz3Q8CGV9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms