Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Setd1bQ8CFT2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Setd1bQ8CFT2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms