Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf428Q8C1M2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Znf428Q8C1M2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Znf428Q8C1M2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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