Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek11Q8C0Q4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms