Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ctdsp2Q8BX07 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ctdsp2Q8BX07 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ctdsp2Q8BX07 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ctdsp2Q8BX07 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ctdsp2Q8BX07 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctdsp2Q8BX07 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ctdsp2Q8BX07 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ctdsp2Q8BX07 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctdsp2Q8BX07 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Ctdsp2Q8BX07 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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