Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pbrm1Q8BSQ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pbrm1Q8BSQ9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pbrm1Q8BSQ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pbrm1Q8BSQ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pbrm1Q8BSQ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms