Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp54Q8BL06 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp54Q8BL06 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms