Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tspan12Q8BKT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tspan12Q8BKT6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms