Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Jmjd4Q8BFT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Jmjd4Q8BFT6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms