Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H2-M10.2Q85ZW9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2-M10.2Q85ZW9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2-M10.2Q85ZW9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms