Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Srgap3Q812A2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srgap3Q812A2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms