Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkhd1l1Q80ZA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 549.8 ms