Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Jph4Q80WT0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Jph4Q80WT0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 676.5 ms