Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Zbed4Q80WQ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zbed4Q80WQ9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Zbed4Q80WQ9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Zbed4Q80WQ9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Zbed4Q80WQ9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zbed4Q80WQ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zbed4Q80WQ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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