Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Npm2Q80W85 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Npm2Q80W85 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Npm2Q80W85 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
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