Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ell3Q80VR2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ell3Q80VR2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms