Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc155Q80VJ8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc155Q80VJ8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc155Q80VJ8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms