Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vgll4Q80V24 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vgll4Q80V24 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms