Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NischQ80TM9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC38■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NischQ80TM9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC37.95■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NischQ80TM9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NischQ80TM9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
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