Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Znf516Q7TSH3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms