Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc93Q7TQK5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms