Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ShprhQ7TPQ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ShprhQ7TPQ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ShprhQ7TPQ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms