Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbno2Q7TNB8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms