Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nme8Q715T0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme8Q715T0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms