Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SynmQ70IV5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SynmQ70IV5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SynmQ70IV5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms