Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sned1Q70E20 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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