Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SpopQ6ZWS8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SpopQ6ZWS8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SpopQ6ZWS8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms