Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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