Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ino80Q6ZPV2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ino80Q6ZPV2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ino80Q6ZPV2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms