Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smpd4Q6ZPR5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd4Q6ZPR5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms