Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ift172Q6VH22 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ift172Q6VH22 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms