Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc46a1Q6PEM8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc46a1Q6PEM8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms