Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2lQ6PDS0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vstm2lQ6PDS0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms