Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rprd2Q6NXI6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rprd2Q6NXI6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rprd2Q6NXI6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms