Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gpbp1Q6NXH3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gpbp1Q6NXH3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms