Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Colgalt2Q6NVG7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colgalt2Q6NVG7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms