Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cpsf6Q6NVF9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cpsf6Q6NVF9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cpsf6Q6NVF9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms