Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HelbQ6NVF4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HelbQ6NVF4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms