Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Frem2Q6NVD0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Frem2Q6NVD0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms