Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn11Q6J756 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Capn11Q6J756 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms