Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt40Q6IFX3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt40Q6IFX3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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