Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nop58Q6DFW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nop58Q6DFW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms