Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cep290Q6A078 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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Cep290Q6A078 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Cep290Q6A078 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cep290Q6A078 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cep290Q6A078 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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