Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Thsd7aQ69ZU6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Thsd7aQ69ZU6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms