Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sptbn2Q68FG2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sptbn2Q68FG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms