Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CltcQ68FD5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CltcQ68FD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CltcQ68FD5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms