Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim24Q64127 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim24Q64127 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms