Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpd52Q62393 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpd52Q62393 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpd52Q62393 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms