Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf6Q62311 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Taf6Q62311 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms